RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM7Q9BQ49 75 aa20.58■□□□□ 0.89
GIPC1-202ENST00000393028 ZFP30Q9Y2G7 519 aa20.58■□□□□ 0.89
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GIPC1-202ENST00000393028 SFTA3P0C7M3 94 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 RBMY1CP0DJD4 496 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 DEFB135Q30KP9 77 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 Q6ZQT7 251 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 C7orf71A4D174 169 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 INSP01308 110 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 UQCC3Q6UW78 93 aa20.56■□□□□ 0.88
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GIPC1-202ENST00000393028 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF727A8MUV8 499 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 SBSPONQ8IVN8 264 aa20.56■□□□□ 0.88
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GIPC1-202ENST00000393028 IGLV2-8P01709 118 aa20.55■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 SMUG1Q53HV7 270 aa20.55■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM183AQ8IXX5 376 aa20.55■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa20.55■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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GIPC1-202ENST00000393028 MLST8Q9BVC4 326 aa20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 RETNQ9HD89 108 aa20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 SOHLH1Q5JUK2 328 aa20.53■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 MGST1P10620 155 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 C1orf158Q8N1D5 194 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-202ENST00000393028 PRR27Q6MZM9 219 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 CRIP1P50238 77 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 Q6AWC8 147 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 Q6ZWC4 215 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 COX8CQ7Z4L0 72 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 OCC1Q8TAD7 63 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 K7EN84 100 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 FAM74A3Q4VXF1 159 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 RCHY1Q96PM5 261 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM208Q9BTX3 173 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM218A2RU14 115 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 B9D2Q9BPU9 175 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 SH2D1AO60880 128 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 PFN1P07737 140 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 ADCYAP1P18509 176 aa20.47■□□□□ 0.87
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GIPC1-202ENST00000393028 MUC21Q5SSG8 566 aa20.47■□□□□ 0.87
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GIPC1-202ENST00000393028 FAM162BQ5T6X4 162 aa20.46■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 LINC01587Q99440 93 aa20.46■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 C20orf144Q9BQM9 153 aa20.46■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 DNAH9Q9NYC9 4486 aa20.46■□□□□ 0.87
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM241Q24JQ0 296 aa20.45■□□□□ 0.86
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GIPC1-202ENST00000393028 C11orf21Q9P2W6 132 aa20.45■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 NAT8Q9UHE5 227 aa20.45■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 SPRY2O43597 315 aa20.44■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 LINC01551Q86U37 167 aa20.44■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 HTN1P15515 57 aa20.43■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM256Q8N2U0 113 aa20.43■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 TM2D3Q9BRN9 247 aa20.43■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 FABP5P3A8MUU1 101 aa20.43■□□□□ 0.86
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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GIPC1-202ENST00000393028 LY96Q9Y6Y9 160 aa20.43■□□□□ 0.86
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GIPC1-202ENST00000393028 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa20.4■□□□□ 0.86
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GIPC1-202ENST00000393028 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-202ENST00000393028 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-202ENST00000393028 ORM1P02763 201 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-202ENST00000393028 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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GIPC1-202ENST00000393028 BIN3Q9NQY0 253 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-202ENST00000393028 C19orf71A6NCJ1 209 aa20.37■□□□□ 0.85
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