RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361545.9

CLIP2-202, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLIP2, Length 5,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2-202ENST00000361545 GUSBP1Q15486 140 aa14.67□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.67□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 C9JQL5 133 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 POU2AF1Q16633 256 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 Q8NFD4 153 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 H3BUA1 57 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 HIVEP2P31629 2446 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.65□□□□□ -0.06
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CLIP2-202ENST00000361545 A8MWV9 139 aa14.65□□□□□ -0.06
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CLIP2-202ENST00000361545 THAP8Q8NA92 274 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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CLIP2-202ENST00000361545 C3orf79P0CE67 100 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP2-202ENST00000361545 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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CLIP2-202ENST00000361545 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.63□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 HSD52Q0P140 79 aa14.63□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 ANAPC13Q9BS18 74 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 FXYD5Q96DB9 178 aa14.63□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 PIEZO1Q92508 2521 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 ZNF479Q96JC4 524 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.62□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.61□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.61□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.6□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 VWC2LB2RUY7 222 aa14.59□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 FAM231BA6NCW3 169 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 CT83Q5H943 113 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 AJUBAQ96IF1 538 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 A0A0J9YY99 117 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP2-202ENST00000361545 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.58□□□□□ -0.07
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CLIP2-202ENST00000361545 PRR20DP86480 221 aa14.58□□□□□ -0.08
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CLIP2-202ENST00000361545 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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CLIP2-202ENST00000361545 A0A1B0GUS0 222 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLIP2-202ENST00000361545 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 STPG4Q8N801 248 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 IGLV2-23P01705 113 aa14.56□□□□□ -0.08
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CLIP2-202ENST00000361545 GNRH2O43555 120 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 PFN2P35080 140 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 ESDP10768 282 aa14.55□□□□□ -0.08
CLIP2-202ENST00000361545 GP9P14770 177 aa14.55□□□□□ -0.08
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