RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 AMBPP02760 352 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 EVI2AP22794 236 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 DEFB131AP59861 70 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 BATFQ16520 125 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 FAM209BQ5JX69 171 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 AMN1Q8IY45 258 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 INAFM1C9JVW0 142 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 MYCNOSP40205 109 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 TEX29Q8N6K0 151 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 IGHG4P01861 327 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 YPEL4Q96NS1 127 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 KNCNA6PVL3 124 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SAP30O75446 220 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PF4P02776 101 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 CD7P09564 240 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PYY3Q5JQD4 70 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 ZNF702PQ9H963 129 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 ELANEP08246 267 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 RCHY1Q96PM5 261 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SMIM17P0DL12 118 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 CRIP1P50238 77 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 Q6ZSV7 163 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PSMB8P28062 276 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 C20orf173Q96LM9 149 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 IGLV2-11P01706 119 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 MAST4O15021 2626 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SCGB2A2Q13296 93 aa8.85□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 ZNF124Q15973 351 aa8.85□□□□□ -0.99
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HPS1-204ENST00000361490 CD28P10747 220 aa8.85□□□□□ -0.99
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HPS1-204ENST00000361490 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.85□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 D6R8Y8 96 aa8.85□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 TSTD3H0UI37 97 aa8.85□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.85□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 C18orf15Q96N68 181 aa8.85□□□□□ -0.99
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HPS1-204ENST00000361490 TYMSP04818 313 aa8.84□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.84□□□□□ -0.99
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HPS1-204ENST00000361490 PRELID3AQ96N28 172 aa8.84□□□□□ -0.99
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HPS1-204ENST00000361490 NIT1Q86X76 327 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 LINC00477Q96M19 166 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 ESM1Q9NQ30 184 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 IFITM10A6NMD0 228 aa8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 C2orf70A6NJV1 201 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 ASIPP42127 132 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 ZNF492Q9P255 531 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 CBY3A6NI87 242 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-204ENST00000361490 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
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