RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 MORN5Q5VZ52 161 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 PATE2Q6UY27 113 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 DTX2Q86UW9 622 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1-17P01599 117 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 CDKN1BP46527 198 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 NPC2P61916 151 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 H3BUA1 57 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 LINC00158P58513 81 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 Q8NA96 180 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 CRPP02741 224 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 IGHV4-59P01825 116 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 ELANEP08246 267 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 NPYP01303 97 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 KIR3DS1Q14943 382 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 M0R2P5 195 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 GP9P14770 177 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 TSPAN13O95857 204 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 RASL10AQ92737 203 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZPA2 131 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 LY6G5BQ8NDX9 201 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 RHODO00212 210 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 IGLV1-47P01700 117 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 DEFB130BP0DP73 79 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 DEFB130AP0DP74 79 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 GAGE13Q4V321 117 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 SPXQ9BT56 116 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-201ENST00000345716 IGLV2-23P01705 113 aa16.27■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 ESDP10768 282 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGLC2P0DOY2 106 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGLC3P0DOY3 106 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 NCKAP5O14513 1909 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 TMEM86BQ8N661 226 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 TIMM21Q9BVV7 248 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 ALPK3Q96L96 1907 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 A8MWV9 139 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 F6UB75 175 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 CD5LO43866 347 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 J3QKU1 62 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 E7EUB6 86 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 SNHG12Q9BXW3 62 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 CKS1BP61024 79 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 CTSGP08311 255 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 IGLL1P15814 213 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 Q8N7P7 452 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 C10orf142B7Z368 130 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 Q8N9W7 124 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 I3L3M4 83 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 TEX22C9J3V5 150 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 FOXE3Q13461 319 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 ZNF124Q15973 351 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 TMEM141Q96I45 108 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 INS-IGF2F8WCM5 200 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 BLCAPP62952 87 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 UBE2V1Q13404 147 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-201ENST00000345716 GAGE12JA6NER3 117 aa16.21■□□□□ 0.18
NISCH-201ENST00000345716 CFHR3Q02985 330 aa16.21■□□□□ 0.18
NISCH-201ENST00000345716 GAGE1Q13065 139 aa16.21■□□□□ 0.18
NISCH-201ENST00000345716 GAGE4Q13068 117 aa16.21■□□□□ 0.18
NISCH-201ENST00000345716 GAGE5Q13069 117 aa16.21■□□□□ 0.18
NISCH-201ENST00000345716 CFHR4Q92496 578 aa16.21■□□□□ 0.18
NISCH-201ENST00000345716 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113 ms