RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 ATP5G1P05496 136 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ATP5G2Q06055 141 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE2BQ13066 116 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE2EQ4V326 116 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 C17orf77Q96MU5 243 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 DPM3Q9P2X0 92 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 KNTC1P50748 2209 aa7.37□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 FAM186AA6NE01 2351 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 A0A087WW49 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE12JA6NER3 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 B9A039 149 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE7O76087 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE12FP0CL80 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE12GP0CL81 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE12IP0CL82 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 GAGE4Q13068 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 EBI3Q14213 229 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ATXN8Q156A1 80 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 PRR31Q5SQ13 230 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 TIMD4Q96H15 378 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 LINC00477Q96M19 166 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 IMUPQ9GZP8 106 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM126AQ9H061 195 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 CTSZQ9UBR2 303 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 C5orf42Q9H799 3197 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 H3BT86 120 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ACYP1P07311 99 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 XGP55808 180 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 CCL8P80075 99 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 LY6DQ14210 128 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 HES3Q5TGS1 186 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 AMTNQ6UX39 209 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 AGRNO00468 2067 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 A0A0J9YY99 117 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 SLC25A20O43772 301 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 NXPH4O95158 308 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV1-69P01742 117 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 MT-ATP8P03928 68 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 IFITM1P13164 125 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 PSMB2P49721 201 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 HES1Q14469 280 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 PMVKQ15126 192 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 TTC32Q5I0X7 151 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 NFE4Q86UQ8 179 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF575Q86XF7 245 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 BAALCQ8WXS3 180 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-202ENST00000341403 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 F8W735 103 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 OVOL1O14753 267 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 BUB3O43684 328 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 RHOHQ15669 191 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CFHR4Q92496 578 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CCL17Q92583 94 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms