RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ZNF3-202ENST00000299667 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.59□□□□□ -1.35
ZNF3-202ENST00000299667 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CLEC3BP05452 202 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 EFNA4P52798 201 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ECSCRQ19T08 205 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SPTA1P02549 2419 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 WFDC2Q14508 124 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 C15orf32Q32M92 178 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CEND1Q8N111 149 aa6.57□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 Q8N8P6 123 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CNFNQ9BYD5 112 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 KLK15Q9H2R5 256 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 HIGD1BQ9P298 99 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 J3KRW8 73 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 PRTN3P24158 256 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 LINC01559Q495D7 138 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 PIFOQ8TCI5 191 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 AGRNO00468 2067 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 LINC01546A6NGU7 62 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ODF3BA8MYP8 253 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 BUB3O43684 328 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ATP5LO75964 103 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 AMTNQ6UX39 209 aa6.57□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.57□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 LINC01548A6NM66 108 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 IGLL5B9A064 214 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 LAGE3Q14657 143 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 NRACQ8N912 160 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 TM2D2Q9BX73 214 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 G3V318 75 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 H3BMG7 143 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 TIMD4Q96H15 378 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF479Q96JC4 524 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 HIST1H4GQ99525 98 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.55□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 IGF1P05019 195 aa6.55□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.55□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 E9PLD3 99 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 H3BVH4 76 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CDSNQ15517 529 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 A0A087WX48 190 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 M0R1W7 72 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ATP6V0E1O15342 81 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.54□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.54□□□□□ -1.36
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ZNF3-202ENST00000299667 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 AZU1P20160 251 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 DEFB1P60022 68 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.362e-11■■□□□ 12.5
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ZNF3-202ENST00000299667 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 PRR9Q5T870 116 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC140Q96MF4 163 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 AKAP6Q13023 2319 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF3-202ENST00000299667 M0R381 172 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 SFTA2Q6UW10 78 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF3-202ENST00000299667 RBAKDNA6NC62 111 aa6.52□□□□□ -1.37
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