RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TMEM219Q86XT9 240 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TAX1BP3O14907 124 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-11P01762 117 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 NDPQ00604 133 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ZNF56Q15929 161 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WX48 190 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 VCYO14598 125 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DRB4P13762 266 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 POLEQ07864 2286 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CDKN1BP46527 198 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TTC32Q5I0X7 151 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 VCX2Q9H322 139 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DMBP28068 263 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CRIP1P50238 77 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TMEM141Q96I45 108 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ZNF479Q96JC4 524 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 VWC2LB2RUY7 222 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 B4DSR2 109 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CD7P09564 240 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 DSCAMO60469 2012 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 H3BUX3 64 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 FCN3O75636 299 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 EMP1P54849 157 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 DKK2Q9UBU2 259 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GWB2 263 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPM0 123 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 COX6B1P14854 86 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 HTN1P15515 57 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SFTA2Q6UW10 78 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 F8VRH5 84 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CEND1Q8N111 149 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RAX2Q96IS3 184 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CSTL1Q9H114 145 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ZNF815PA8K554 130 aa6.84□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PRSS2P07478 247 aa6.84□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.84□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 DUX5Q96PT3 197 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TGFAP01135 160 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 GNLYP22749 145 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 LY6DQ14210 128 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CREBBPQ92793 2442 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PRAC2D3DTV9 90 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 MSMBP08118 114 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 GLMPQ8WWB7 406 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 COPS9Q8WXC6 57 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PEMTQ9UBM1 199 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PLCE1Q9P212 2302 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 BRCA2P51587 3418 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 FOXE3Q13461 319 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CNFNQ9BYD5 112 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ODF1Q14990 250 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CCDC140Q96MF4 163 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 GAGE13Q4V321 117 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PIFOQ8TCI5 191 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.81□□□□□ -1.32
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