RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 PPBPP02775 128 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC21A0A140T8X8 626 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NDX4 124 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMS2P0C7Q2 107 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC21Q5SSG8 566 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ANK2Q01484 3957 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-17P01599 117 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 CT45A10P0DMU9 189 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 U3KQK5 164 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF785A8K8V0 405 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTFRP26992 372 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF138P52744 262 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 OOSP1A8MZH6 123 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZS46 218 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 CSN3P07498 182 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PLGLAQ15195 96 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZSV7 163 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 COX8CQ7Z4L0 72 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS9BQ3B8N2 356 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMG4Q5JS54 123 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS9CQ6DKI2 356 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM89A2RUT3 159 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF414Q96IQ9 312 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 AAMDCQ9H7C9 122 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BLCAPP62952 87 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 HES1Q14469 280 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF125Q96EQ8 232 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL15Q9H469 300 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EIM0 57 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 APELAP0DMC3 54 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR31Q5SQ13 230 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF491Q8N8L2 437 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CST9LQ9H4G1 147 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T8A6NH00 312 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SIVA1O15304 175 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 COTL1Q14019 142 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM97Q5BJF2 176 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf91Q6ZV80 131 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG9Q00887 426 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ORMDL3Q8N138 153 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087X0K7 114 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM104BQ5XKR9 115 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9G4Q8NGQ1 327 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NDN8 102 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 H0Y8G0 127 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CRIP1P50238 77 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM189A5PLL7 270 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CNIH1O95406 144 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM106CPP0CH98 169 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 OCIAD2Q56VL3 154 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01006Q8NI28 216 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TP73-AS1Q9UF72 201 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CBY3A6NI87 242 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PRELID3AQ96N28 172 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM11P17152 192 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PLXNB1O43157 2135 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf71A4D174 169 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 IL4P05112 153 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 EBI3Q14213 229 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM15Q7Z3B0 74 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf77Q96MU5 243 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF702PQ9H963 129 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BRM9 83 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ERU9 68 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA7O95182 113 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HBDP02042 147 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF6P10767 208 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A7P31151 101 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM95Q3KNT9 176 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N6K4 173 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 D6R8Y8 96 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 LYZL1Q6UWQ5 148 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4X2Q8NGF9 303 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A096LNJ9 63 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB2A1O75556 95 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 NPBQ8NG41 125 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 NBR2O15453 112 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 BMI1P35226 326 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD52Q0P140 79 aa20.21■□□□□ 0.83
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