RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 FREM3P0C091 2139 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 NOTCH2Q04721 2471 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 C9JAW5 83 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV2-70P01814 119 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 SIGMAR1Q99720 223 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 SCN5AQ14524 2016 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 NRGNQ92686 78 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 CRYGCP07315 174 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0G2JRQ6 117 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 RNF144BQ7Z419 303 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 RNF183Q96D59 192 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 FAM231BA6NCW3 169 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 PTPRFP10586 1907 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 IGLL5B9A064 214 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZRM9 215 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 STPG4Q8N801 248 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 K7EM74 188 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 RNF152Q8N8N0 203 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-201ENST00000220888 CFPP27918 469 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 PROK2Q9HC23 129 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 QRFPP83859 136 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 CFHR4Q92496 578 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087X0K7 114 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 WT1-ASQ06250 92 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ESM1Q9NQ30 184 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 F6UB75 175 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFB1O75438 58 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 SPINK8P0C7L1 97 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 PCP4P48539 62 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGHG4P01861 327 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C3orf79P0CE67 100 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB135Q30KP9 77 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 VOPP1Q96AW1 172 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 MPDZO75970 2070 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 WDR86Q86TI4 376 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGLC1P0CG04 106 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 INSL3P51460 131 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C5orf38Q86SI9 138 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 CXCL1P09341 107 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 BLCAPP62952 87 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 COX7A2LO14548 114 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 KIR3DS1Q14943 382 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 MORN5Q5VZ52 161 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 AMTNQ6UX39 209 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 PLCE1Q9P212 2302 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 K7EQD1 137 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 RNF138Q8WVD3 245 aa8.3□□□□□ -1.08
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