RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 Q6ZVH6 145 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 AKAP6Q13023 2319 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 H3BUA1 57 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 GAS8-AS1O95177 125 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 TNFRSF6BO95407 300 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFA4O00483 81 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 IGHG2P01859 326 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 CACNG7P62955 275 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 C16orf92Q96LL3 132 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 ITPR1Q14643 2758 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 USMG5Q96IX5 58 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 CCL19Q99731 98 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 A6NDX4 124 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 FGF6P10767 208 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 UBE2V1Q13404 147 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 DEFB125Q8N687 156 aa13.21□□□□□ -0.29
CLDN11-201ENST00000064724 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 SNAI2O43623 268 aa13.21□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 TRBV12-3P01733 135 aa13.21□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 FCER1GP30273 86 aa13.21□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 GPHB5Q86YW7 130 aa13.21□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 C20orf173Q96LM9 149 aa13.21□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 ABCA2Q9BZC7 2435 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 CCL25O15444 150 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 FOXE3Q13461 319 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 PRSS47A8MTI9 375 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 SOCS3O14543 225 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 EVI2AP22794 236 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 LINC00477Q96M19 166 aa13.2□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.19□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 TAX1BP3O14907 124 aa13.19□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 PTTG1IPP53801 180 aa13.19□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 LEPP41159 167 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 Q8N8P6 123 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 H3BUX3 64 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 PRR9Q5T870 116 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 Q6ZQT7 251 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.18□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 LY6EQ16553 131 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 OVOL1O14753 267 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 CD5LO43866 347 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 MSMBP08118 114 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 ATP5J2P56134 94 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 NRACQ8N912 160 aa13.17□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 PSMG4Q5JS54 123 aa13.16□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 KLK15Q9H2R5 256 aa13.16□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 ZMAT4Q9H898 229 aa13.16□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 DKK2Q9UBU2 259 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 SIVA1O15304 175 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 IGLV1-40P01703 118 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 BLCAPP62952 87 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.15□□□□□ -0.3
CLDN11-201ENST00000064724 OR4X2Q8NGF9 303 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 C18orf15Q96N68 181 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV3-11P01762 117 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 ODF1Q14990 250 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.14□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 A0A0G2JLM5 398 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 H3BVH4 76 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 SEC11AP67812 179 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 MRAP2Q96G30 205 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 PF4V1P10720 104 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 CFHR3Q02985 330 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 Q6ZS46 218 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.13□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 VAMP3Q15836 100 aa13.12□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF580Q9UK33 172 aa13.12□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.12□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 SMPXQ9UHP9 88 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 B4DSR2 109 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 ATP5LO75964 103 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 SMIM17P0DL12 118 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 LAGE3Q14657 143 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.11□□□□□ -0.31
CLDN11-201ENST00000064724 A1L4Q6 167 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms