RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 KHDC3LQ587J8 217 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TMED6Q8WW62 240 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF503Q96F45 646 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PAXXQ9BUH6 204 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 MBD2Q9UBB5 411 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 DNAH2Q9P225 4427 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 C7orf71A4D174 169 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 H3BTX0 84 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 RNF141Q8WVD5 230 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 AQP10Q96PS8 301 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ZNF492Q9P255 531 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ALG5Q9Y673 324 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 PKHD1P08F94 4074 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SNURFLB1AK76 121 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 OR7C2O60412 319 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 M6PRP20645 277 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 CSN1S1P47710 185 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ICAM4Q14773 271 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 BLNKQ8WV28 456 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 MUC4Q99102 2169 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 DEFB130BP0DP73 79 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 DEFB130AP0DP74 79 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ZNF138P52744 262 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SERF2P84101 59 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 KIR3DS1Q14943 382 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZR54 194 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 MED28Q9H204 178 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 MBP02144 154 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 PRM2P04554 102 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 OR10J4P0C629 311 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 HTN3P15516 51 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TCL1AP56279 114 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ERCC8Q13216 396 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SUN5Q8TC36 379 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 Q9H3A6 140 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 WFDC1Q9HC57 220 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 OTORQ9NRC9 128 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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PKP4-218ENST00000629219 DIRC3C9JPN6 131 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 F5H768 121 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SPINK4O60575 86 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 GPX1P07203 203 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 HTN1P15515 57 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 BTN1A1Q13410 526 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 FCN2Q15485 313 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 Q6AWC8 147 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 VGLL1Q99990 258 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 STAG3L2P0CL84 134 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 STAG3L3P0CL85 134 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 CCL18P55774 89 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 RANP62826 216 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 CD300CQ08708 224 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SLAQ13239 276 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TDRG1Q3Y452 100 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 ATG101Q9BSB4 218 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 UPK3BQ9BT76 320 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-218ENST00000629219 A0A1B0GVY2 172 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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