RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626012.2

HDAC10-222, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5 BASIC

Gene HDAC10, Length 2,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-222	ENST00000626012	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	EVI2A	P22794	236 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	FA2H	Q7L5A8	372 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	ACACB	O00763	2458 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	PRELID3A	Q96N28	172 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	IGF1	P05019	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	CBY3	A6NI87	242 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	PDE6H	Q13956	83 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	THYN1	Q9P016	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	CACNG7	P62955	275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	GAGE1	Q13065	139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	CKS2	P33552	79 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	LMO4	P61968	165 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC10-222	ENST00000626012	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	BUB3	O43684	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	FBN2	P35556	2912 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	C20orf202	A1L168	122 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	TRGV3	P03979	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	PSG9	Q00887	426 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	EBI3	Q14213	229 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	LINC01545	Q5VT33	79 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	ORMDL3	Q8N138	153 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	ST20	Q9HBF5	79 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	LY6E	Q16553	131 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	PET117	Q6UWS5	81 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	GNLY	P22749	145 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012		Q6ZS46	218 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	UBE2E1	P51965	193 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	NHLH1	Q02575	133 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	TAX1BP3	O14907	124 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	PRR9	Q5T870	116 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-222	ENST00000626012	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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