RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600155.1

LINC00649-211, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 1,108 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-211ENST00000600155 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.3□□□□□ -1.24
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LINC00649-211ENST00000600155 FGF7P21781 194 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-211ENST00000600155 TIRAPP58753 221 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-211ENST00000600155 BTN1A1Q13410 526 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF266Q14584 549 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-211ENST00000600155 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.24□□□□□ -1.25
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LINC00649-211ENST00000600155 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-211ENST00000600155 RASL10AQ92737 203 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-211ENST00000600155 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.24□□□□□ -1.25
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