RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 PRR27Q6MZM9 219 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ASCL2Q99929 193 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 V9GYV3 84 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 AGRNO00468 2067 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 TFPI2P48307 235 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 PAFAH1B2P68402 229 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ERCC8Q13216 396 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM61Q8N0U2 210 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 FAM24BQ8N5W8 94 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 C8orf49Q96NF6 230 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 PRR25Q96S07 402 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 SORL1Q92673 2214 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 COLCA2A8K830 154 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF688P0C7X2 276 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF138P52744 262 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ELOBQ15370 118 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 IMMP2LQ96T52 175 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 CITED1Q99966 193 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 JMJD1CQ15652 2540 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 PF4P02776 101 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 CT45A10P0DMU9 189 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 S100PP25815 95 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 DEFB1P60022 68 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 PSMG4Q5JS54 123 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 NUDT11Q96G61 164 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 IL36BQ9NZH7 164 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-227ENST00000598960 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00477Q96M19 166 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 F6UB75 175 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 P01737 135 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 CXCL1P09341 107 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 SMUG1Q53HV7 270 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 CT83Q5H943 113 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 A0A1W2PPQ1 181 aa10.56□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 OR4C46A6NHA9 309 aa10.56□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 SH2D1AO60880 128 aa10.56□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 SAP30O75446 220 aa10.56□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 CRIP1P50238 77 aa10.56□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 A0A0J9YX75 114 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 RAB5AP20339 215 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 PRIMA1Q86XR5 153 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.55□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 IGLV1-51P01701 117 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 TSKUQ8WUA8 353 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 BTF3L4Q96K17 158 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 FAM210BQ96KR6 192 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 ODF3Q96PU9 254 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms