RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718		K7EQG2	157 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	CRYBB3	P26998	211 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	UBE2G2	P60604	165 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	RNF125	Q96EQ8	232 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	PARL	Q9H300	379 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FCHO1-222	ENST00000597718	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	LYZ	P61626	148 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718		C9JCJ5	164 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	IL4	P05112	153 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ATP5G3	P48201	142 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718		Q8NAQ8	132 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	BTF3L4	Q96K17	158 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718		H3BRN7	92 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	NDUFB4	O95168	129 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	TAS2R60	P59551	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	GLMP	Q8WWB7	406 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	GPR82	Q96P67	336 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718		U3KQE9	123 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	AGRN	O00468	2067 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	HELT	A6NFD8	242 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	OR10J4	P0C629	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	PDE6H	Q13956	83 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	RNF212	Q495C1	297 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SMIM12	Q96EX1	92 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	MEOX2	P50222	304 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ADIRF	Q15847	76 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718		X6R8D5	127 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	IGLL5	B9A064	214 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	PYY	P10082	97 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	S100P	P25815	95 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	PSG9	Q00887	426 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	BIN3	Q9NQY0	253 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FCHO1-222	ENST00000597718	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718		K7EQM0	130 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF253	O75346	499 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	MIF	P14174	115 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	AKR1C3	P42330	323 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	GNG4	P50150	75 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	LINC01551	Q86U37	167 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718		H7BYZ3	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	PEX7	O00628	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms