RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061		M0R3E3	92 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF253	O75346	499 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	BCL2L11	O43521	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	PFDN1	O60925	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ATP5G1	P05496	136 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	LEP	P41159	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ATP5G3	P48201	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	RNF212	Q495C1	297 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	CBY3	A6NI87	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	NDUFB4	O95168	129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	NUDT3	O95989	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	SERF2	P84101	59 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ERCC8	Q13216	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	PKHD1	P08F94	4074 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	M6PR	P20645	277 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	PDE6H	Q13956	83 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	RTL8C	O15255	209 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	MB	P02144	154 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	ICAM4	Q14773	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	HERC2	O95714	4834 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	PKD1	P98161	4303 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	RAB2A	P61019	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR10J4	P0C629	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1W2PPV4	95 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	C7orf71	A4D174	169 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE7	O76087	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR5I1	Q13606	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061		Q6ZR54	194 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	TAS2R45	P59539	299 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	OR7C2	O60412	319 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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