RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 MTURNQ8N3F0 131 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35E1Q96K37 410 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 K7EMT4 169 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV3-20P01619 116 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 CD7P09564 240 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF90Q03938 601 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 IL15RAQ13261 267 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 MARC2Q969Z3 335 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM8Q96KF7 97 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RNF2Q99496 336 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 SMPXQ9UHP9 88 aa5.52□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 SMCO3A2RU48 225 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP92A6NM28 416 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 L7N2F9 121 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 C1QBP02746 253 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RLN2P04090 185 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 IL4P05112 153 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 LEPP41159 167 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 CAV2P51636 162 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 PLP1P60201 277 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 AKR1C1Q04828 323 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR2F1Q13607 317 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 Q8WTZ3 238 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 HYLS1Q96M11 299 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 GINS3Q9BRX5 216 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 IGSF23A1L1A6 192 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 CST7O76096 145 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 MPC2O95563 127 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RD3LP0DJH9 198 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TFPI2P48307 235 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R30P59541 319 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TCF24Q7RTU0 167 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB125Q8N687 156 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 METTL26Q96S19 204 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 VSIRQ9H7M9 311 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 PKHD1P08F94 4074 aa5.5□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 HMSDA8MTL9 139 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF253O75346 499 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 DEDDO75618 318 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 NPPCP23582 126 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 CRYBB3P26998 211 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 LYZP61626 148 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TRGV9Q99603 122 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TUBA4BQ9H853 241 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RABAC1Q9UI14 185 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GWB2 263 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR11H12B2RN74 326 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF345Q14585 488 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 RETNQ9HD89 108 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 DOK5Q9P104 306 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0D9SG52 128 aa5.47□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.47□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 OR4C46A6NHA9 309 aa5.47□□□□□ -1.53
ATG4D-210ENST00000588972 G3V3Q6 166 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms