RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 VGLL1Q99990 258 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-ND4LP03901 98 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF688P0C7X2 276 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00477Q96M19 166 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 NDFIP1Q9BT67 221 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS10P5Q9NQ39 176 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 LENEPQ9Y5L5 61 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SORL1Q92673 2214 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMG4Q5JS54 123 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8A1Q8NGG7 326 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ANAPC16Q96DE5 110 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPB6E9PJ23 425 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EN84 100 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 COX8CQ7Z4L0 72 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM24BQ8N5W8 94 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 CTDSP1Q9GZU7 261 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 MGST1P10620 155 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF138P52744 262 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf66Q5T8R8 295 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR25Q96S07 402 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM242Q9NWH2 141 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R2P9O14990 202 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 SFRP2Q96HF1 295 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC9Q8NEX5 89 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF492Q9P255 531 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF212Q495C1 297 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 NHLRC2Q8NBF2 726 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 IZUMO1RA6ND01 250 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC8Q13216 396 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 EBLN2Q6P2I7 272 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXI2Q6ZQN5 318 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM231DQ6ZW35 169 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 OSTCQ9NRP0 149 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CD33P20138 364 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf54Q8N8G6 183 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A10P0DMU9 189 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5I1Q13606 314 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0J9YX75 114 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVFC1-1P60608 527 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10G8Q8NGN5 311 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8TAT8 98 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM110AQ9BQ89 295 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP6D1Q9H9H5 199 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf65A6NEN9 183 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB131AP59861 70 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SMUG1Q53HV7 270 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF3Q96PU9 254 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SMCO4Q9NRQ5 59 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 F6UB75 175 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 H7BYZ3 331 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SCO1O75880 301 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBA4BQ9H853 241 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 AGRNO00468 2067 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR27Q6MZM9 219 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf49Q96NF6 230 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR61Q9BZJ8 451 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 BEAN1Q3B7T3 259 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB1P60022 68 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM19A4Q96LR4 140 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf71A6NCJ1 209 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-206ENST00000588815 WIPF1O43516 503 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DRB4P13762 266 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CRISP2P16562 243 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 GDF5OSQ5U4N7 250 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT10Q8NFP7 164 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT11Q96G61 164 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11H12B2RN74 326 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 BTN1A1Q13410 526 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF3L2Q3SX64 289 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4B1Q8NGF8 309 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 IMMP2LQ96T52 175 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCL2Q99929 193 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MTW9 85 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM162BQ5T6X4 162 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 V9GYV3 84 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 GATCO43716 136 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 P01737 135 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM88Q6PEY1 159 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 APRG1Q8IVJ8 170 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CLUHP3Q96NS8 147 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CT83Q5H943 113 aa23.04■■□□□ 1.28
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