RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SIGMAR1Q99720 223 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 PLCE1Q9P212 2302 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMA1P25391 3075 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 OVOL1O14753 267 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CTSGP08311 255 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 HERVK_113P61574 105 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 HES1Q14469 280 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS57Q6UWY2 283 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 DTX2Q86UW9 622 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM158Q8WZ71 300 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF479Q96JC4 524 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00477Q96M19 166 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf77Q96MU5 243 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 JMJD8Q96S16 334 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXC2Q99958 501 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA25Q9BR10 227 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PRD5 423 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PRF3 423 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PRM7 423 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM223BA6NKX1 122 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 F8W735 103 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 BUB3O43684 328 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM11P17152 192 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 RRN3P1Q2M238 152 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 PCP2Q8IVA1 136 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 DKK2Q9UBU2 259 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CADP27708 2225 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SZT2Q5T011 3432 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLL5B9A064 214 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BUA1 57 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 M0QXV9 152 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE13Q4V321 117 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 NRACQ8N912 160 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM6Q96B49 74 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H4GQ99525 98 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BMG7 143 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 KLK10O43240 276 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SAP30O75446 220 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 APELAP0DMC3 54 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 FXYD2P54710 66 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SCGB2A2Q13296 93 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf74Q32Q52 190 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB37Q96AX2 223 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM141Q96I45 108 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 U3KQE9 123 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIOO75962 3097 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHG4P01861 327 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ASIPP42127 132 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2E1P51965 193 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C18orf15Q96N68 181 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM160Q9NX00 188 aa5.96□□□□□ -1.46
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