RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 LINC00862A6NCI5 91 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 K7EIL1 84 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 IGLV2-11P01706 119 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TUBA4BQ9H853 241 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ZNF492Q9P255 531 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CT45A10P0DMU9 189 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 ZNF138P52744 262 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 ERCC8Q13216 396 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PEA15Q15121 130 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 FMC1Q96HJ9 113 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CRISP2P16562 243 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 AKR1C3P42330 323 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TAS2R60P59551 318 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 LINC00479Q96M42 142 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PSG8Q9UQ74 426 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 IGKV3-20P01619 116 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 AMBPP02760 352 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TSPOP30536 169 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 UBE2G1P62253 170 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 UQCC3Q6UW78 93 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CSTL1Q9H114 145 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 KLLNB2CW77 178 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 C9JQL5 133 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 UBE2CO00762 179 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 LTAP01374 205 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 LEPP41159 167 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CDKN1BP46527 198 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 APOC4P55056 127 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 Q86TA4 180 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 Q8TAT8 98 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TVP23CQ96ET8 276 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SMIM12Q96EX1 92 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 DERL1Q9BUN8 251 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 C9JCJ5 164 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PRNTQ86SH4 94 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 COMMD7Q86VX2 200 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SGK494Q96LW2 274 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 MLST8Q9BVC4 326 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PARLQ9H300 379 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TREM1Q9NP99 234 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 M0R2Z0 102 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 BAGE2Q86Y30 109 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 GPX1P07203 203 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 GNG4P50150 75 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 DEFA6Q01524 100 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 SMUG1Q53HV7 270 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 CENPWQ5EE01 88 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.4□□□□□ -1.06
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