RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 MBD2Q9UBB5 411 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 HSPB11Q9Y547 144 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 DAD1P61803 113 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 Q5BKY6 102 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF503Q96F45 646 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 ATP5SQ99766 215 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 OR51M1Q9H341 326 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 OR10J4P0C629 311 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB130BP0DP73 79 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB130AP0DP74 79 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 ICAM4Q14773 271 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 OXA1LQ15070 435 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZQT7 251 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 FXYD5Q96DB9 178 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 VGLL1Q99990 258 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 PKD1P98161 4303 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF253O75346 499 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TAS2R60P59551 318 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 CD300CQ08708 224 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 PAXXQ9BUH6 204 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 FUT9Q9Y231 359 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 M0R2N4 97 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 IFNA5P01569 189 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 TSPOP30536 169 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 RANP62826 216 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 MED28Q9H204 178 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 LYRM9A8MSI8 78 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 F5H768 121 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 H7BYZ3 331 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 OR7C2O60412 319 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PTTG1O95997 202 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PET100P0DJ07 73 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 LEPP41159 167 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 BTN1A1Q13410 526 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PDE6HQ13956 83 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PRR9Q5T870 116 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 NUDT11Q96G61 164 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 C16orf74Q96GX8 76 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00477Q96M19 166 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PRELID1Q9Y255 219 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 CBY3A6NI87 242 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 P0DMU3 169 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 FAM231AP0DMU4 169 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 FAM231CP0DMU5 169 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ODF3Q96PU9 254 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 Q9H3A6 140 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE12BA1L429 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 C7orf71A4D174 169 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 KLLNB2CW77 178 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE7O76087 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GPX1P07203 203 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE12FP0CL80 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE12GP0CL81 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE12IP0CL82 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 RAB2AP61019 212 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 Q8TAT8 98 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 FAM210BQ96KR6 192 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 HYLS1Q96M11 299 aa6.8□□□□□ -1.32
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