RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LINC00518Q8N0U6 118 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR2D3Q8NGH3 330 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GTSF1Q8WW33 167 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HLA-DQA1P01909 254 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q8TAT8 98 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C16orf92Q96LL3 132 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 YAE1D1Q9NRH1 226 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UBE2E2Q96LR5 201 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TLN2Q9Y4G6 2542 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RAB4BP61018 213 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPR61Q9BZJ8 451 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMPXQ9UHP9 88 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NDFIP1Q9BT67 221 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UFC1Q9Y3C8 167 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ERCC8Q13216 396 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDZD11Q5EBL8 140 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMR3AQ99954 134 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM162BQ5T6X4 162 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1B0GXF2 115 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SOCS3O14543 225 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SH2D1AO60880 128 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GZMBP10144 247 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 S100A2P29034 98 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PGLYRP4Q96LB8 373 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NRN1Q9NPD7 142 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTORP42345 2549 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LURAP1LQ8IV03 231 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM181BA6NEQ2 426 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLHDC1Q8N7A1 406 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPL11P62913 178 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GDF5OSQ5U4N7 250 aa20.08■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C20orf173Q96LM9 149 aa20.08■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A087WW49 117 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EDN2P20800 178 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BMI1P35226 326 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HBBP68871 147 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 REC114Q7Z4M0 266 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM213A2RRL7 107 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 APCSP02743 223 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMIM6P0DI80 62 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CRISP2P16562 243 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM78Q5T7P6 136 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SONP18583 2426 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRIFINA4D1Z8 144 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A8MWP6 167 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CAMPP49913 170 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF138P52744 262 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q6ZSV7 163 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF738Q8NE65 137 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C12orf57Q99622 126 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ESM1Q9NQ30 184 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM189A5PLL7 270 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LGALS9O00182 355 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOSL1P15407 271 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HIST1H2BLQ99880 126 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FABP4P15090 132 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLAQ13239 276 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIAA1644Q3SXP7 199 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q6AWC8 147 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1B0GUS0 222 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR10D4PQ8NGN7 298 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYNJ2BPP57105 145 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q0VG73 95 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCGB2A2Q13296 93 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FABP5P3A8MUU1 101 aa20.01■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HAX1O00165 279 aa20.01■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OVOL1O14753 267 aa20.01■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LY6G6DO95868 133 aa20.01■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1B0GUT8 65 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AMBPP02760 352 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPS20P60866 119 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM256Q8N2U0 113 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM160Q9NX00 188 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SAMD13Q5VXD3 122 aa20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa19.99■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa19.99■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C18orf65Q6ZTR6 163 aa19.99■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LENEPQ9Y5L5 61 aa19.99■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SELENOKQ9Y6D0 94 aa19.99■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SRIP30626 198 aa19.98■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR10J3Q5JRS4 329 aa19.98■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR10J6PQ8NGY7 276 aa19.98■□□□□ 0.79
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C4orf3Q8WVX3 66 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms