RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 MGST2Q99735 147 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 FABP12A6NFH5 140 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 K7EP13 123 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 SFTA3P0C7M3 94 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 GYPEP15421 78 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 ARL16Q0P5N6 197 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 PRR9Q5T870 116 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 Q8N814 137 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 SYT8Q8NBV8 401 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM63Q969Q1 353 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.75□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 GPX1P07203 203 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 GUK1Q16774 197 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF479Q96JC4 524 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 SOSTQ9BQB4 213 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 Q9HAA7 133 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 TNFSF8P32971 234 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 AP3S2P59780 193 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 MIC13Q5XKP0 118 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00477Q96M19 166 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 C9orf170A2RU37 121 aa11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 TSC22D2O75157 780 aa11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 C4orf46Q504U0 113 aa11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZRG5 221 aa11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.71□□□□□ -0.53
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF253O75346 499 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 CRISP2P16562 243 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 CAMLGP49069 296 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 PYDC2Q56P42 97 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFB4O95168 129 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 MUC21Q5SSG8 566 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 BLNKQ8WV28 456 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 ORM1P02763 201 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 PYYP10082 97 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 GGACTQ9BVM4 153 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 SRRQ9GZT4 340 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 PRELID1Q9Y255 219 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 C9JCJ5 164 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 C1QBP02746 253 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 PPT1P50897 306 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 TAS2R30P59541 319 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 Q8TAT8 98 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 PFDN5Q99471 154 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf66A4D0T2 115 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 RAB31Q13636 194 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 WFDC2Q14508 124 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZSA8 131 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-30P01768 117 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-33P01772 117 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 NMBP08949 121 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF492Q9P255 531 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms