RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	TAS2R60	P59551	318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	RBAKDN	A6NC62	111 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185		K7EQM0	130 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	NMB	P08949	121 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF138	P52744	262 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	VGLL1	Q99990	258 aa		11.48	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.47	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	C1QB	P02746	253 aa		11.47	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.47	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.46	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
AKAP13-215	ENST00000560185	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.46	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	C7orf71	A4D174	169 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	AGRN	O00468	2067 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1W2PRE2	83 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	IFNA7	P01567	189 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	CRISP2	P16562	243 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	PRM2	P04554	102 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	AZU1	P20160	251 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	KLLN	B2CW77	178 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	RGS13	O14921	159 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	DAD1	P61803	113 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185		Q6ZTC4	211 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185		Q8TAT8	98 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	CBY3	A6NI87	242 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	IGLL5	B9A064	214 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	TCRA	P04437	139 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	FHIT	P49789	147 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	RAB5C	P51148	216 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	UBE2G2	P60604	165 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	GNG5	P63218	68 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	CD300C	Q08708	224 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.41	□□□□□ -0.58
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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