RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF24	Q9Y225	148 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HSPB11	Q9Y547	144 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAH2	Q9P225	4427 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A0J9YWU9	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	CXorf65	A6NEN9	183 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BRN7	92 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ISLR	O14498	428 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR7C2	O60412	319 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10J4	P0C629	311 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SPP1	P10451	314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMB3	P49720	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PSG9	Q00887	426 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OPCML	Q14982	345 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PSG3	Q16557	428 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		Q5BKY6	102 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		Q6ZWC4	215 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF183	Q96D59	192 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MFF	Q9GZY8	342 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BMM0	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BQ15	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ARPC5	O15511	151 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PYY	P10082	97 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PLP1	P60201	277 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	VWC2	Q2TAL6	325 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OR51M1	Q9H341	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A0J9YX75	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		M0R2Z0	102 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TNFRSF6B	O95407	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB2A	P61019	212 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ERCC8	Q13216	396 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	LCN15	Q6UWW0	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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