RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00477Q96M19 166 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FUT9Q9Y231 359 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CENPXA8MT69 81 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 L7N2F9 121 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VAMP2P63027 116 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLAQ13239 276 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRIQKQ629K1 86 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NFE4Q86UQ8 179 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PFDN5Q99471 154 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SRRQ9GZT4 340 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRELID1Q9Y255 219 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.43□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HERC1Q15751 4861 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KLLNB2CW77 178 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPINK4O60575 86 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MPDU1O75352 247 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NXPH4O95158 308 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NMBP08949 121 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TCL1AP56279 114 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERCC8Q13216 396 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BAK1Q16611 211 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MIC13Q5XKP0 118 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MITD1Q8WV92 249 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRO0255Q9UI72 69 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC160A6NGH7 325 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 M0R3E3 92 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IFNA5P01569 189 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GPX1P07203 203 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CRISP2P16562 243 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCAP31P51572 246 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 XGP55808 180 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CD300CQ08708 224 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BTN1A1Q13410 526 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PDE6HQ13956 83 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF846Q147U1 533 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FRZBQ92765 325 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.41□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 K7EP13 123 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RGS13O14921 159 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CST7O76096 145 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NDUFB4O95168 129 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 S100A11P31949 105 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BTCP35070 178 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAV2P51636 162 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CRYBA4P53673 196 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VWC2Q2TAL6 325 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VGLL1Q99990 258 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A087WTM6 91 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCSO14618 274 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRAF2O60831 178 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGHV3-53P01767 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HBG1P69891 147 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HBG2P69892 147 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BAXQ07812 192 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FHL2Q14192 279 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q5VSD8 79 aa6.39□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.39□□□□□ -1.39
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