RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 RNF7Q9UBF6 113 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 OARD1Q9Y530 152 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SCN2AQ99250 2005 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SCN3AQ9NY46 2000 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 hDV102S1A0JD36 115 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 RBAKDNA6NC62 111 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 C17orf100A8MU93 164 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SNURFLB1AK76 121 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 INAFM1C9JVW0 142 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 PLAUP00749 431 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 IGKCP01834 107 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 FOXF2Q12947 444 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 FHL3Q13643 280 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 OR52N5Q8NH56 324 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 NABP1Q96AH0 204 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 NMNAT3Q96T66 252 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 GTF3C1Q12789 2109 aa5.47□□□□□ -1.53
ITGB7-211ENST00000551887 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 LINC01619G3V211 115 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 H3BT86 120 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 EFNA2O43921 213 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF20P17024 532 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 SSR2P43308 183 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 NFE4Q86UQ8 179 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 MMD2Q8IY49 270 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 RNF182Q8N6D2 247 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 HCFC1P51610 2035 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 LEPROTL1O95214 131 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CLPSP04118 112 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ELANEP08246 267 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CD7P09564 240 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 COL8A2P25067 703 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CCL8P80075 99 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ARL16Q0P5N6 197 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 INSL4Q14641 139 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 LINC00311Q8N616 119 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CKLFQ9UBR5 152 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 RNF114Q9Y508 228 aa5.45□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 VPS13CQ709C8 3753 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 UBE2E1P51965 193 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 BRK1Q8WUW1 75 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CCL19Q99731 98 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 OTORQ9NRC9 128 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 PCTPQ9UKL6 214 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 IL4P05112 153 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 CTLA4P16410 223 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 DAD1P61803 113 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 NNATQ16517 81 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 LINC01559Q495D7 138 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms