RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, human

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF823	P16415	610 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	DYNLT3	P51808	116 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CCL20	P78556	96 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IQGAP2	Q13576	1575 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MIC13	Q5XKP0	118 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SCX	Q7RTU7	201 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C5orf38	Q86SI9	138 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718		Q8N976	141 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SPTSSA	Q969W0	71 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	OTOF	Q9HC10	1997 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PTPRF	P10586	1907 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TCHH	Q07283	1943 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABCC1	P33527	1531 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	hADV29S1	A0JD25	119 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C19orf84	I3L1E1	186 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BCE1	O60756	84 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FSTL3	O95633	263 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BGLAP	P02818	100 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PRM2	P04554	102 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C3orf79	P0CE67	100 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CKS2	P33552	79 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LINC00313	P59037	77 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FUT5	Q11128	374 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	GUSBP11	Q6P575	273 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MDP1	Q86V88	176 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LINC01600	Q96MT4	127 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	DSCR8	Q96T75	97 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	HIGD1B	Q9P298	99 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	EPDR1	Q9UM22	224 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRIP11	Q15643	1979 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PHLPP1	O60346	1717 aa		2.54	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LRP4	O75096	1905 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718		K7EM74	188 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TIMM17B	O60830	172 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CXCL8	P10145	99 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	UBE2A	P49459	152 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PRNT	Q86SH4	94 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LINC00643	Q86TS7	51 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C3orf56	Q8N813	242 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM243	Q9BU79	118 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	NMES1	Q9C002	83 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TSPOAP1	O95153	1857 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718		A0A1B0GUL6	1792 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CUL7	Q14999	1698 aa		2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718		A0A0D9SEW6	157 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718		C9JCJ5	164 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	CCL16	O15467	120 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	PRH1	P02810	166 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		2.52	□□□□□ -2.01
GNPTAB-208	ENST00000550718	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01

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