RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TAS2R45P59539 299 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 ZNF266Q14584 549 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 VGLL1Q99990 258 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 Q9H3A6 140 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 C7orf71A4D174 169 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 G3V3Q6 166 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 DEFB130BP0DP73 79 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 DEFB130AP0DP74 79 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 CRISP2P16562 243 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 BTN1A1Q13410 526 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-219ENST00000550655 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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CS-219ENST00000550655 CD300CQ08708 224 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 TMEM78Q5T7P6 136 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 PRR9Q5T870 116 aa12.52□□□□□ -0.41
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CS-219ENST00000550655 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ZNF492Q9P255 531 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 TNFSF18Q9UNG2 199 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ATP6V0CP27449 155 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 TMEM88Q6PEY1 159 aa12.51□□□□□ -0.41
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CS-219ENST00000550655 OR10G7Q8NGN6 311 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 Q8TAT8 98 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 FRAS1Q86XX4 4008 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa12.5□□□□□ -0.41
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CS-219ENST00000550655 RBAKDNA6NC62 111 aa12.5□□□□□ -0.41
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CS-219ENST00000550655 PQLC2Q6ZP29 291 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 CCDC28AQ8IWP9 274 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 SH3BGRL3Q9H299 93 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 P0DMU3 169 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 FAM231AP0DMU4 169 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 FAM231CP0DMU5 169 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ZNF138P52744 262 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 NACAE9PAV3 2078 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 CBY3A6NI87 242 aa12.48□□□□□ -0.41
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CS-219ENST00000550655 GPX1P07203 203 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 CSN1S1P47710 185 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 Q6ZQT7 251 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 OTORQ9NRC9 128 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ATP5G1P05496 136 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 STAG3L2P0CL84 134 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 STAG3L3P0CL85 134 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ARL14EPLP0DKL9 152 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ATP5G3P48201 142 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 SERF2P84101 59 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 DNAH10Q8IVF4 4471 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 SNURFLB1AK76 121 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 F5H768 121 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 ZNF680Q8NEM1 530 aa12.46□□□□□ -0.41
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CS-219ENST00000550655 HYLS1Q96M11 299 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-219ENST00000550655 PGPA6NDG6 321 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 MBP02144 154 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 SSX7Q7RTT5 188 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 SUN5Q8TC36 379 aa12.45□□□□□ -0.42
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CS-219ENST00000550655 GAGE7O76087 117 aa12.44□□□□□ -0.42
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CS-219ENST00000550655 GAGE12GP0CL81 117 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GAGE12IP0CL82 117 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 TMED6Q8WW62 240 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 RPH3ALQ9UNE2 315 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 LENEPQ9Y5L5 61 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 SMLR1H3BR10 107 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GCHFRP30047 84 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GNG5P63218 68 aa12.43□□□□□ -0.42
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