RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 RNF144BQ7Z419 303 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 GATD1Q8NB37 220 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 V9GYV3 84 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE2EQ4V326 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf82Q6UX34 121 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRB-208ENST00000550358 SNAI2O43623 268 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 FXYD7P58549 80 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C8orf49Q96NF6 230 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 CCL24O00175 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WWL8 130 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-53P01767 116 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB130BP0DP73 79 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB130AP0DP74 79 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087X0K7 114 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 G3V318 75 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE12JA6NER3 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE1Q13065 139 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE4Q13068 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE5Q13069 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 XCL2Q9UBD3 114 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 CRYGCP07315 174 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZVH6 145 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 STPG4Q8N801 248 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 SOCS3O14543 225 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-208ENST00000550358 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-208ENST00000550358 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 PRORYQ9H606 182 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 CTSZQ9UBR2 303 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-208ENST00000550358 I3L2K1 104 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 LY6HO94772 140 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 F8VRH5 84 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IFITM1P13164 125 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF726P1Q15940 193 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-208ENST00000550358 ODF3Q96PU9 254 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-208ENST00000550358 KIR3DS1Q14943 382 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE12BA1L429 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE7O76087 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE12FP0CL80 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE12GP0CL81 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE12IP0CL82 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 CXCL5P42830 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM213A2RRL7 107 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZWC4 215 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 COX8AP10176 69 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.67□□□□□ -1.34
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