RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 Q8N6K4 173 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR4A5Q8NH83 315 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR4C12Q96R67 309 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 GINS3Q9BRX5 216 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 JPT2Q9H910 190 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00862A6NCI5 91 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 H3BP45 60 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 H7C423 109 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CST7O76096 145 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFA3O95167 84 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MSMBP08118 114 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NMBP08949 121 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IAPPP10997 89 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 M6PRP20645 277 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CNTFRP26992 372 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 DYNLT3P51808 116 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PRCDQ00LT1 54 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NPBQ8NG41 125 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MALSU1Q96EH3 234 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PSENENQ9NZ42 101 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SMPXQ9UHP9 88 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PRNDQ9UKY0 176 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ACANP16112 2415 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0J9YXV3 536 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 B4DSR2 109 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MOSP00540 346 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 HBG1P69891 147 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 HBG2P69892 147 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SPINK9Q5DT21 86 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 VSIRQ9H7M9 311 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MED9Q9NWA0 146 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RFNGQ9Y644 331 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NPFFO15130 113 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TCAPO15273 167 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFS5O43920 106 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IFNA17P01571 189 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-48P01763 117 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SEC11BP0C7V7 166 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 WT1-ASQ06250 92 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFA5Q16718 116 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 Q8NBF4 154 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 OR1P1Q8NH06 330 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 Q8WTZ3 238 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 MARC2Q969Z3 335 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 VGLL1Q99990 258 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 REG4Q9BYZ8 158 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 PRO0628Q9UI54 55 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GXF2 115 aa3.01□□□□□ -1.93
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