RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 TCTAP57738 103 aa13.26□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 Q9H3A6 140 aa13.26□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.26□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 M6PRP20645 277 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ATP6V0CP27449 155 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 KHDC3LQ587J8 217 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C16orf74Q96GX8 76 aa13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C7orf71A4D174 169 aa13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 KLLNB2CW77 178 aa13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 LYRM9A8MSI8 78 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SSX7Q7RTT5 188 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 DNAH6Q9C0G6 4158 aa13.23□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 HYLS1Q96M11 299 aa13.22□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 LINC00477Q96M19 166 aa13.22□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF492Q9P255 531 aa13.22□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 A0A1W2PPV4 95 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CRISP2P16562 243 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TAS2R45P59539 299 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GNG5P63218 68 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF266Q14584 549 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TSTA3-211ENST00000529899 NACAE9PAV3 2078 aa13.2□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 DIRC3C9JPN6 131 aa13.2□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.2□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.2□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GAGE12BA1L429 117 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 F5H768 121 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GAGE7O76087 117 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GPX1P07203 203 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GAGE12FP0CL80 117 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GAGE12GP0CL81 117 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GAGE12IP0CL82 117 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF138P52744 262 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ASB13Q8WXK3 278 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 RAB24Q969Q5 203 aa13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 PGPA6NDG6 321 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ARPC5O15511 151 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 Q6ZTI0 123 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 OTORQ9NRC9 128 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.18□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 STAG3L2P0CL84 134 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 STAG3L3P0CL85 134 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 CSN1S1P47710 185 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF726P1Q15940 193 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 SGK494Q96LW2 274 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 CBY3A6NI87 242 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ATP5G1P05496 136 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 HOXA5P20719 270 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GCHFRP30047 84 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 ATP5G3P48201 142 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.16□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 RBAKDNA6NC62 111 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 SNURFLB1AK76 121 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 M0R2N4 97 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 P0DMU3 169 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 FAM231AP0DMU4 169 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 FAM231CP0DMU5 169 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 MUC21Q5SSG8 566 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 TVP23CQ96ET8 276 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 FAM210BQ96KR6 192 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-211ENST00000529899 F6UZH7 168 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.2 ms