RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528118.5

TMPRSS4-217, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 3,838 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-217ENST00000528118 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 F5H697 171 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 WISP2O76076 250 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 EFNA4P52798 201 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 C20orf78Q9BR46 151 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ACACAQ13085 2346 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 RRN3P1Q2M238 152 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.7□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 A8MWV9 139 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SNCGO76070 127 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PRTN3P24158 256 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PLNP26678 52 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ODF1Q14990 250 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PRR25Q96S07 402 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 C16orf97H3BN30 126 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PRRG2O14669 202 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 DLX6P56179 175 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ERCC8Q13216 396 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 HIGD1BQ9P298 99 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 GATA4P43694 442 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 DSCAMO60469 2012 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 H3BRN7 92 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ECSCRQ19T08 205 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 LINC01559Q495D7 138 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 H7C1H1 209 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGKV1-17P01599 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TIMM23O14925 209 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 HLA-DMBP28068 263 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 CRIP1P50238 77 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 INSL3P51460 131 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 EMP1P54849 157 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 FRYQ5TBA9 3013 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 K7EM74 188 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGHG3P01860 377 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 DTX2Q86UW9 622 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 A0A096LNJ9 63 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 E9PLD3 99 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TMEM178BH3BS89 294 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGLV2-23P01705 113 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGLV2-11P01706 119 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 LYNX1P0DP58 116 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 BSPH1Q075Z2 132 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PDE6HQ13956 83 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 Q8N8P6 123 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 GLMPQ8WWB7 406 aa6.67□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 NBR2O15453 112 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 CRYGCP07315 174 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 HLA-DRB4P13762 266 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 GAGE2BQ13066 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TAL2Q16559 108 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 GAGE2EQ4V326 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PTH2Q96A98 100 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 FOXI1Q12951 378 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 C16orf92Q96LL3 132 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 FRYLO94915 3013 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 AGRNO00468 2067 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 B5MCH6 92 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 TMEM262E9PQX1 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 GFRALQ6UXV0 394 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 RNF182Q8N6D2 247 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 VCX2Q9H322 139 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 REV3LO60673 3130 aa6.66□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 F8VRH5 84 aa6.65□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 SLC25A16P16260 332 aa6.65□□□□□ -1.34
TMPRSS4-217ENST00000528118 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.65□□□□□ -1.34
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