RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	COX6A1	P12074	109 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	PRDX2	P32119	198 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SSR4	P51571	173 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CCL11	P51671	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	DLX1	P56177	255 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	PAX8	Q06710	450 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945		Q6ZQT7	251 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TDH	Q8IZJ6	230 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	PATE1	Q8WXA2	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C1orf159	Q96HA4	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C20orf173	Q96LM9	149 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945		J3QLI3	93 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	OVOL1	O14753	267 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CXCL10	P02778	98 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	GRP	P07492	148 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	LIF	P15018	202 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	FXYD7	P58549	80 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	NPC2	P61916	151 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CCL8	P80075	99 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TCF15	Q12870	199 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	EBI3	Q14213	229 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	GGN	Q86UU5	652 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	JPT2	Q9H910	190 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	LRP4	O75096	1905 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF785	A8K8V0	405 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945		K7EM74	188 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	OVOL3	O00110	214 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SH2D1A	O60880	128 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MED14OS	P0DP75	135 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	GP9	P14770	177 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	COL8A2	P25067	703 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	ADAMTS20	P59510	1910 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	PDE6H	Q13956	83 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C1orf195	Q5TG92	126 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	METTL26	Q96S19	204 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945		H0Y8X5	98 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945		H7C2G1	150 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	CXCL13	O43927	109 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	PLAU	P00749	431 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	LYZ	P61626	148 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STAU2-209	ENST00000520945	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92

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