RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	DAD1	P61803	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	IL18	Q14116	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552	MUC4	Q99102	2169 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A087WZ39	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		M0R2N4	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	AP3S2	P59780	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A087X0K7	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		F6UB75	175 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		K7EPK0	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SYNGR2	O43760	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5G1	P05496	136 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	CXCL2	P19875	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5G3	P48201	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TMBIM6	P55061	237 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	FXYD7	P58549	80 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB1	P60022	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	PLP1	P60201	277 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SELENOT	P62341	195 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SPCS2	Q15005	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		Q8NBF4	154 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		H3BRN7	92 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		K7EQD1	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	HTN3	P15516	51 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	CCL18	P55774	89 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R60	P59551	318 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2F1	Q13607	317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		H3BNG1	76 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		H7BYZ3	331 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552		M0R2Z0	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAP1	O75689	374 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	IAPP	P10997	89 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	ORM2	P19652	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	CXCL3	P19876	107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66

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