RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 Q86TA4 180 aa5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 A0A1W2PPI3 338 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 M0QZ24 198 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 CHEK1O14757 476 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 SIVA1O15304 175 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 IGLV2-11P01706 119 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 COX8AP10176 69 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 COL8A2P25067 703 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 CAMPP49913 170 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 COTL1Q14019 142 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 MAJINQ3KP22 176 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 S100A7AQ86SG5 101 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 PIFOQ8TCI5 191 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 JMJD8Q96S16 334 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 Q9H3A6 140 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 U3KQK5 164 aa5.65□□□□□ -1.5
SMIM20-202ENST00000514384 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.65□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 COL7A1Q02388 2944 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 LCE6AA0A183 80 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 A0A1B0GUT8 65 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 E7EUB6 86 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 RBP4P02753 201 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 CD40P25942 277 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 CSN1S1P47710 185 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 GNG5P63218 68 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 VAMP3Q15836 100 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 MPV17L2Q567V2 206 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 FAM201AQ5SY85 155 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TCF24Q7RTU0 167 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 ATOH7Q8N100 152 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 LYSTQ99698 3801 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 C17orf100A8MU93 164 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 SHISA9B4DS77 424 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PPIAL4DF5H284 164 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM178BH3BS89 294 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 K7EQM0 130 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 NDUFB3O43676 98 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 NUDT3O95989 172 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 IGLC1P0CG04 106 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 CT45A10P0DMU9 189 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 GPR183P32249 361 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PDE6HQ13956 83 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PRR27Q6MZM9 219 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.63□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 LINC01546A6NGU7 62 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF785A8K8V0 405 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 TEX22C9J3V5 150 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 H3BRM9 83 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 H3BRN7 92 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 I3L2K1 104 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 CD3EP07766 207 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 ORM2P19652 201 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 HTR1DP28221 377 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.62□□□□□ -1.51
SMIM20-202ENST00000514384 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms