RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-215	ENST00000514141	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGKC	P01834	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	NIT1	Q86X76	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	PTPRB	P23467	1997 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141		I3L3M4	83 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SLC17A3	O00476	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SERF1A	O75920	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	FABP2	P12104	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	CD33	P20138	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	GNG5	P63218	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141		U3KQE9	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	WISP2	O76076	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	APELA	P0DMC3	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	ACACA	Q13085	2346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141		K7ERU9	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	DLEU1	O43261	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	CSN3	P07498	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	CITED1	Q99966	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	PROP1	O75360	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	VAMP3	Q15836	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141		M0R3E3	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SPINK4	O60575	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	TFF1	P04155	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	CCL24	O00175	119 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141		Q8N2B8	174 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.53	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	SNAI2	O43623	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	PRSS2	P07478	247 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141		Q6ZPA2	131 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POLK-215	ENST00000514141	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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