RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MPDU1O75352 247 aa13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HOXB5P09067 269 aa13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VAMP1P23763 118 aa13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF546Q86UE3 836 aa13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.38□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GOSR2O14653 212 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR4E1P0C645 316 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SRIP30626 198 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERCC8Q13216 396 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP1R1AQ13522 171 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.37□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TIRAPP58753 221 aa13.36□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 E5RGE8 158 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 M0R3E3 92 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PSCAO43653 123 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ORM1P02763 201 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 METTL15P1P0C7V9 234 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 Q6ZQT7 251 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR10P1Q8NGE3 313 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GGACTQ9BVM4 153 aa13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COX7A2P2O60397 106 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GYPEP15421 78 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARL16Q0P5N6 197 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPCS2Q15005 226 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RASL10AQ92737 203 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF479Q96JC4 524 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MGST2Q99735 147 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MGAT4CQ9UBM8 478 aa13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NDUFB4O95168 129 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAS2R30P59541 319 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRR9Q5T870 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF213Q63HN8 5207 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC160A6NGH7 325 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SSSCA1O60232 199 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSC22D2O75157 780 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GPX1P07203 203 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM63Q969Q1 353 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BCL7BQ9BQE9 202 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRELID1Q9Y255 219 aa13.32□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SFTA3P0C7M3 94 aa13.31□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGS13O14921 159 aa13.3□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMBIM6P55061 237 aa13.3□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa13.3□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.3□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NOL3O60936 208 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDE6HQ13956 83 aa13.29□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WFDC2Q14508 124 aa13.29□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.29□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.29□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C9orf170A2RU37 121 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C9JCJ5 164 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNFSF8P32971 234 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BLNKQ8WV28 456 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF492Q9P255 531 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.28□□□□□ -0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FABP12A6NFH5 140 aa13.27□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 Q6ZRG5 221 aa13.27□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCXQ7RTU7 201 aa13.27□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAB2BQ8WUD1 216 aa13.27□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.27□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CAMLGP49069 296 aa13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AP3S2P59780 193 aa13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LAGE3Q14657 143 aa13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPXQ9BT56 116 aa13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SRRQ9GZT4 340 aa13.26□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C7orf66A4D0T2 115 aa13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TDRG1Q3Y452 100 aa13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NRARPQ7Z6K4 114 aa13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOMM5Q8N4H5 51 aa13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PFDN5Q99471 154 aa13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms