RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 GCHFRP30047 84 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 MYCNOSP40205 109 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SYNJ2BPP57105 145 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 ZNF726P1Q15940 193 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 UQCC3Q6UW78 93 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PET117Q6UWS5 81 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 COMMD7Q86VX2 200 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 VAX2Q9UIW0 290 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 F6UZH7 168 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PAFAH1B2P68402 229 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PSG9Q00887 426 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 C17orf77Q96MU5 243 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 FAM210AQ96ND0 272 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TREM1Q9NP99 234 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SMPXQ9UHP9 88 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PRE2 83 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 A8MWP6 167 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 OVOL1O14753 267 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 BUB3O43684 328 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PDE6DO43924 150 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 OR10J4P0C629 311 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 BCL2P10415 239 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 ID1P41134 155 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CSN1S1P47710 185 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PDE6HQ13956 83 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 HAGHQ16775 308 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 DEFB136Q30KP8 78 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 LEMD1Q68G75 181 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 BLNKQ8WV28 456 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 COL7A1Q02388 2944 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 C11orf94C9JXX5 98 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 K7EQM0 130 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CHEK1O14757 476 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 ZNF253O75346 499 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PYYP10082 97 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 GP9P14770 177 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CBLN1P23435 193 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 UBE2G2P60604 165 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CCL20P78556 96 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SSX7Q7RTT5 188 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 FXYD5Q96DB9 178 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 CITED1Q99966 193 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PRELID1Q9Y255 219 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 A0A087X0K7 114 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GUV1 79 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TMEM213A2RRL7 107 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 PGPA6NDG6 321 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 C2orf70A6NJV1 201 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 FAM74A7A6NL05 159 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 FOLR2P14207 255 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 RANP62826 216 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TCF24Q7RTU0 167 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 NFE4Q86UQ8 179 aa5.47□□□□□ -1.53
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