RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510056.5

MATR3-215, Transcript of matrin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MATR3, Length 3,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-215	ENST00000510056	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056		A0A0J9YXV3	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056		H0Y9J4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGLL1	P15814	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056		Q6P435	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	NRAC	Q8N912	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056		A0A087WX48	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PAX4	O43316	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DYNLT3	P51808	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	EMP1	P54849	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TCTA	P57738	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF146	Q15072	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CCL20	P78556	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE5	Q13069	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE6	Q13070	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PKIA	P61925	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	GNB2	P62879	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	STPG4	Q8N801	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056		K7EP13	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PRH1	P02810	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CXCL1	P09341	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PLP2	Q04941	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	SP6	Q3SY56	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	SYNGR2	O43760	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	LTC4S	Q16873	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-215	ENST00000510056	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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