RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	SPTBN2	O15020	2390 aa		5.28	□□□□□ -1.56
FBXO38-208	ENST00000504971	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		5.28	□□□□□ -1.56
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	PGP	A6NDG6	321 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	DPRX	A6NFQ7	191 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SSSCA1	O60232	199 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FCGR3A	P08637	254 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	LMO1	P25800	156 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZR03	302 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZVQ6	151 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	DRAM1	Q8N682	238 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf50	Q96LR7	162 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GXF2	115 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2L6	O14933	153 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	RBP4	P02753	201 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	CD55	P08174	381 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	IL3RA	P26951	378 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	PIGY	Q3MUY2	71 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	OTOR	Q9NRC9	128 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SVIL	O95425	2214 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FRY	Q5TBA9	3013 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A087WZ39	114 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	DIRC3	C9JPN6	131 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971		K7N7A8	449 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	LGALS9	O00182	355 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	NDUFB3	O43676	98 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	CST7	O76096	145 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	EBI3	Q14213	229 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6P435	159 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	POLE	Q07864	2286 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP92	A6NM28	416 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SRRM5	B3KS81	715 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF253	O75346	499 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	LHB	P01229	141 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	BSPH1	Q075Z2	132 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TFF3	Q07654	80 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SPRN	Q5BIV9	151 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	GPHA2	Q96T91	129 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	VSIG4	Q9Y279	399 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	IGF2R	P11717	2491 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF727	A8MUV8	499 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	FSTL3	O95633	263 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV1-46	P01743	117 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	CXCL1	P09341	107 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF688	P0C7X2	276 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM187	Q14656	261 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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