RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499326.1

GABPB1-AS1-201, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 717 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 H3BTX0 84 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NDUFB4O95168 129 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 OR10J4P0C629 311 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HLA-DMBP28068 263 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PDE6HQ13956 83 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PSMG4Q5JS54 123 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SUN5Q8TC36 379 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUDT11Q96G61 164 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LINC00052Q96N35 136 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRELID1Q9Y255 219 aa5.86□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KNCNA6PVL3 124 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RTL8CO15255 209 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CXorf1O96002 111 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GCHFRP30047 84 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FHITP49789 147 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SULT1A2P50226 295 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DEFB1P60022 68 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PSG3Q16557 428 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF575Q86XF7 245 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RNF182Q8N6D2 247 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 BLNKQ8WV28 456 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RNF183Q96D59 192 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 APLNQ9ULZ1 77 aa5.85□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RAB5CP51148 216 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 APOC4P55056 127 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PSG9Q00887 426 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF738Q8NE65 137 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.84□□□□□ -1.47
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 A0A0J9YX75 114 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 A8MTW9 85 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 F6UB75 175 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 H3BMM0 161 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HLA-DRB4P13762 266 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TCTAP57738 103 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NDUFA5Q16718 116 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 STHQ8IWL8 128 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 Q9H3A6 140 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 OTORQ9NRC9 128 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AGRNO00468 2067 aa5.83□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 IGLL5B9A064 214 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRAC2D3DTV9 90 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 M0R3E3 92 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UBE2CO00762 179 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RANP62826 216 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ICAM4Q14773 271 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.82□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 A0A1W2PRE2 83 aa5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PGPA6NDG6 321 aa5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GGTLC3B5MD39 225 aa5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms