RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495949.1

RALGAPB-208, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 3

Gene RALGAPB, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-208	ENST00000495949	CSN1S1	P47710	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	HAGH	Q16775	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MTOR	P42345	2549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CHEK1	O14757	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PAGE4	O60829	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF253	O75346	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	AMBP	P02760	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PYY	P10082	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	FOLR2	P14207	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	GP9	P14770	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ID1	P41134	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	UBE2G2	P60604	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CCL20	P78556	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CITED1	Q99966	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		A0A087X0K7	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	PGP	A6NDG6	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		H3BQ15	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	INSL3	P51460	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CEBPG	P53567	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	RARRES2	Q99969	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		Q9H3A6	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	MLX	Q9UH92	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CUBN	O60494	3623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949		F8W036	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	ISLR	O14498	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	SAP30	O75446	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CSN3	P07498	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	EDN2	P20800	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	S100A1	P23297	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	UBE2G1	P62253	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RALGAPB-208	ENST00000495949	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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