RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495555.6

IFT27-211, Transcript of intraflagellar transport 27, humanhuman

TSL 2

Gene IFT27, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27-211ENST00000495555 ICAM4Q14773 271 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 ATP5SQ99766 215 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 PAXXQ9BUH6 204 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 FUT9Q9Y231 359 aa8.53□□□□□ -1.04
IFT27-211ENST00000495555 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 C7orf71A4D174 169 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 OR7C2O60412 319 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 MPC2O95563 127 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GPX1P07203 203 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 CSN1S1P47710 185 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ERCC8Q13216 396 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 OR5I1Q13606 314 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RNF141Q8WVD5 230 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 HSPB11Q9Y547 144 aa8.52□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GAGE12BA1L429 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GAGE7O76087 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GAGE12FP0CL80 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GAGE12GP0CL81 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GAGE12IP0CL82 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 M6PRP20645 277 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 TAS2R45P59539 299 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 Q6ZR54 194 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 KLLNB2CW77 178 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RTL8CO15255 209 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 OR10J4P0C629 311 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 CRISP2P16562 243 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 FXYD5Q96DB9 178 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ZNF503Q96F45 646 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.5□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RGS13O14921 159 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ZNF138P52744 262 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RANP62826 216 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 CD300CQ08708 224 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 KHDC3LQ587J8 217 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ZNF492Q9P255 531 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 MBD2Q9UBB5 411 aa8.49□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 RBAKDNA6NC62 111 aa8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 H3BNG1 76 aa8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 BTN1A1Q13410 526 aa8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 VGLL1Q99990 258 aa8.48□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 A0A1W2PPV4 95 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 Q6ZTI0 123 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 SSX7Q7RTT5 188 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 Q9H3A6 140 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 HERC1Q15751 4861 aa8.47□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.46□□□□□ -1.05
IFT27-211ENST00000495555 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 A0A0J9YY99 117 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 A0A1B0GVY2 172 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 C18orf15Q96N68 181 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.46□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 HOXA5P20719 270 aa8.45□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 TCL1AP56279 114 aa8.45□□□□□ -1.06
IFT27-211ENST00000495555 ZNF266Q14584 549 aa8.45□□□□□ -1.06
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