RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490705.1

ARF1-211, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARF1, Length 881 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-211ENST00000490705 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 LYRM9A8MSI8 78 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 HTN3P15516 51 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 CSN1S1P47710 185 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.53□□□□□ -0.88
ARF1-211ENST00000490705 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 VGLL1Q99990 258 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.52□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 C7orf71A4D174 169 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 G3V3Q6 166 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ARPC5O15511 151 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 MBP02144 154 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 DEFB130BP0DP73 79 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 DEFB130AP0DP74 79 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 SERF2P84101 59 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 BTN1A1Q13410 526 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.51□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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ARF1-211ENST00000490705 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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ARF1-211ENST00000490705 GPX1P07203 203 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ZNF138P52744 262 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 Q8TAT8 98 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.5□□□□□ -0.89
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ARF1-211ENST00000490705 OTORQ9NRC9 128 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ZNF492Q9P255 531 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.5□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 RBAKDNA6NC62 111 aa9.49□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 PGPA6NDG6 321 aa9.49□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 STAG3L2P0CL84 134 aa9.49□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 STAG3L3P0CL85 134 aa9.49□□□□□ -0.89
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ARF1-211ENST00000490705 CD300CQ08708 224 aa9.49□□□□□ -0.89
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ARF1-211ENST00000490705 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.48□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 FAM210BQ96KR6 192 aa9.48□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 TAAR5O14804 337 aa9.47□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ATP5G1P05496 136 aa9.47□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 GCHFRP30047 84 aa9.47□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 ATP5G3P48201 142 aa9.47□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 KMT2AQ03164 3969 aa9.47□□□□□ -0.89
ARF1-211ENST00000490705 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 CBY3A6NI87 242 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 F5H768 121 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 RGS13O14921 159 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 CXorf1O96002 111 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GNG5P63218 68 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.46□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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ARF1-211ENST00000490705 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.46□□□□□ -0.9
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ARF1-211ENST00000490705 FAM231CP0DMU5 169 aa9.45□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.45□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 SSX7Q7RTT5 188 aa9.45□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.45□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.45□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.45□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GAGE12BA1L429 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GAGE7O76087 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GAGE12FP0CL80 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GAGE12GP0CL81 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 GAGE12IP0CL82 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 ZNF345Q14585 488 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.44□□□□□ -0.9
ARF1-211ENST00000490705 Q6ZQT7 251 aa9.44□□□□□ -0.9
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