RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 H7BYZ3 331 aa14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 NMBP08949 121 aa14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 GCHFRP30047 84 aa14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 TAS2R60P59551 318 aa14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.74□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 TENM2Q9NT68 2774 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 PFDN1O60925 122 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 EMP1P54849 157 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 ERCC8Q13216 396 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 SUN5Q8TC36 379 aa14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 PGPA6NDG6 321 aa14.72□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.72□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 HYLS1Q96M11 299 aa14.72□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 VGLL1Q99990 258 aa14.72□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.72□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 DIRC3C9JPN6 131 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 SEC11BP0C7V7 166 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 CRISP2P16562 243 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF138P52744 262 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 TMUB2Q71RG4 321 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 AKAP14Q86UN6 197 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF492Q9P255 531 aa14.71□□□□□ -0.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 KLLNB2CW77 178 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 UMAD1C9J7I0 102 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 C1QBP02746 253 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 TMED6Q8WW62 240 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 C16orf74Q96GX8 76 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 DKK2Q9UBU2 259 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 CELA1Q9UNI1 258 aa14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 C7orf71A4D174 169 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 J3KRW8 73 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 GPX1P07203 203 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 KIR3DS1Q14943 382 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 ZNF726P1Q15940 193 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.69□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 HTN1P15515 57 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 C12orf74Q32Q52 190 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 Q6ZTC4 211 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 SSX7Q7RTT5 188 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.68□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.67□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 A0A1W2PRE2 83 aa14.67□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 LYRM9A8MSI8 78 aa14.67□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 K7EQM0 130 aa14.67□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 STOML3Q8TAV4 291 aa14.67□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.67□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 Q8TAT8 98 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.66□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 AZU1P20160 251 aa14.65□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 TCTAP57738 103 aa14.65□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NOM1-208ENST00000489850 LCE6AA0A183 80 aa14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 PRM2P04554 102 aa14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 CD300CQ08708 224 aa14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 BTN1A1Q13410 526 aa14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 GGTLC3B5MD39 225 aa14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 TCRAP04437 139 aa14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 DAD1P61803 113 aa14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.62□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 GNG5P63218 68 aa14.62□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.62□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.62□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.62□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 EPDR1Q9UM22 224 aa14.62□□□□□ -0.07
NOM1-208ENST00000489850 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms