RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.89□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM213A2RRL7 107 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MWL6 223 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 PRAC2D3DTV9 90 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SOCS3O14543 225 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 PHOX2AO14813 284 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HILS1P60008 231 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 FRZBQ92765 325 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR25Q96S07 402 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 JMJD8Q96S16 334 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C16orf95Q9H693 158 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NRN1Q9NPD7 142 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.88□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TCF21O43680 179 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BKO60814 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BJP06899 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TRGC1P0CF51 173 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BOP23527 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BBP33778 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SYNJ2BPP57105 145 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BDP58876 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BCP62807 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 COX19Q49B96 90 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TCF24Q7RTU0 167 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF738Q8NE65 137 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8TAT8 98 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf49Q96NF6 230 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 ASCL2Q99929 193 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.87□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C5orf52A6NGY3 159 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01619G3V211 115 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 M0QZ24 198 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 OVOL1O14753 267 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 EDN2P20800 178 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF138P52744 262 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 ERCC8Q13216 396 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR73Q6P4I2 378 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 DPF1Q92782 380 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C20orf173Q96LM9 149 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NEU1Q99519 415 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.86□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM231BA6NCW3 169 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf70A6NJV1 201 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 HIGD1CA8MV81 97 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK4O60575 86 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SH2D1AO60880 128 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA7O95182 113 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 MT-ND6P03923 174 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 CBLN1P23435 193 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 ID1P41134 155 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 CRIP1P50238 77 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA6P56556 154 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB136Q30KP8 78 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SMUG1Q53HV7 270 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 RASL11AQ6T310 242 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP35Q8NFH5 326 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.85□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SNURFLB1AK76 121 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2CO00762 179 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 SLURP1P55000 103 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 OR11H1Q8NG94 326 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01006Q8NI28 216 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 GTSF1Q8WW33 167 aa7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms