RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 RGS13O14921 159 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 GPX1P07203 203 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 CDKN1BP46527 198 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 Q8N1Y9 231 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 C20orf173Q96LM9 149 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 ZMAT4Q9H898 229 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 RAB19A4D1S5 217 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 J3QL48 77 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 INSP01308 110 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV3-20P01619 116 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-DMBP28068 263 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 TAS2R60P59551 318 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 CCL20P78556 96 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 TOR2AQ5JU69 321 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 UQCC3Q6UW78 93 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM12Q96EX1 92 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 TREM1Q9NP99 234 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 F6UB75 175 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ATP5G3P48201 142 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 GNG4P50150 75 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 CEBPGP53567 150 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PRNTQ86SH4 94 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF492Q9P255 531 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PSG8Q9UQ74 426 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 GNG5P63218 68 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFA5Q16718 116 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SMUG1Q53HV7 270 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZWC4 215 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf52Q96A22 123 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RCHY1Q96PM5 261 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ASCL2Q99929 193 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PRAC2D3DTV9 90 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 IFITM2Q01629 132 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ERCC8Q13216 396 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 BAGE2Q86Y30 109 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RARRES2Q99969 163 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 VGLL1Q99990 258 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA25Q9BR10 227 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 C7orf71A4D174 169 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 A8MTW9 85 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF727A8MUV8 499 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 K7EIL1 84 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 CRISP2P16562 243 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF124Q15973 351 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 KCNS1Q96KK3 526 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 XCL2Q9UBD3 114 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 XKRY2A2RUG3 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 H7BYZ3 331 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 M0R2Z0 102 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SPRY2O43597 315 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 LTAP01374 205 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 Q86TA4 180 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms