RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 AMN1Q8IY45 258 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR6V1Q8N148 313 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PFN4Q8NHR9 129 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PYURFQ96I23 114 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CEP19Q96LK0 163 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CCL13Q99616 98 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PRRT1Q99946 306 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TAS2R1Q9NYW7 299 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 KAAG1Q9UBP8 84 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 V9GYQ6 96 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR5H14A6NHG9 310 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ODF3BA8MYP8 253 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM238C9JI98 176 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 M0QZK8 103 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CDC42EP2O14613 210 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 NDUFA2O43678 99 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF682O95780 498 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 NRASP01111 189 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HRASP01112 189 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 KRASP01116 189 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF32P17041 273 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CDK2P24941 298 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TGFBR1P36897 503 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HERVK_113P63121 156 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HIST1H3AP68431 136 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PRDX4Q13162 271 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HACD4Q5VWC8 232 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM42Q69YG0 159 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TBPL2Q6SJ96 375 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM144Q7Z5S9 345 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC18Q8N456 261 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 LINC00471Q8N535 108 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR4A5Q8NH83 315 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 BTF3L4Q96K17 158 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 DCSTAMPQ9H295 470 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF391Q9UJN7 358 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CELA1Q9UNI1 258 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR6C6A6NF89 314 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 GADD45GO95257 159 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 MT-CO2P00403 227 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CTLA4P16410 223 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CRABP1P29762 137 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 FXYD6P3P58550 94 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 LINC00313P59037 77 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PMAIP1Q13794 54 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 C1orf194Q5T5A4 169 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 DHFR2Q86XF0 187 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR5AS1Q8N127 324 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 C5orf56Q8N8D9 126 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 Q8NAQ8 132 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 OR10X1Q8NGY0 326 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 Q96M85 177 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 VCXQ9H320 206 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF286AQ9HBT8 521 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 LINC00846Q9NV44 126 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 IQCF6A8MYZ5 107 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 BHLHE40O14503 412 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 RER1O15258 196 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 NDUFB3O43676 98 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 IL4P05112 153 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 G0S2P27469 103 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 MAP2K4P45985 399 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-208ENST00000482785 RAB14P61106 215 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms