RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 Q6ZWC4 215 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 LINC00477Q96M19 166 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 ATG101Q9BSB4 218 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 TENM3Q9P273 2699 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 IGLV2-11P01706 119 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 BCL2P10415 239 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 FXYD7P58549 80 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 Q8TAT8 98 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 M0R2Z0 102 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 PEX7O00628 323 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 ZNF492Q9P255 531 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 XCL2Q9UBD3 114 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 COL7A1Q02388 2944 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 C11orf94C9JXX5 98 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 CRISP2P16562 243 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 ZNF138P52744 262 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 DEFB135Q30KP9 77 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 RETNQ9HD89 108 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 IFNA1P01562 189 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 KIR3DS1Q14943 382 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RNF183Q96D59 192 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 LINC00479Q96M42 142 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 KLLNB2CW77 178 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 AMBPP02760 352 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 CDKN1BP46527 198 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 C11orf52Q96A22 123 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TVP23CQ96ET8 276 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 SPATA25Q9BR10 227 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 VAX2Q9UIW0 290 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TSPOP30536 169 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 LEPP41159 167 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 SGK494Q96LW2 274 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 K7EQM0 130 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 PRR9Q5T870 116 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RCHY1Q96PM5 261 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RARRES2Q99969 163 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 PSG8Q9UQ74 426 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 F6UZH7 168 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 SPRY2O43597 315 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 FAM210AQ96ND0 272 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 INSP01308 110 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 Q86TA4 180 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 PDE6DO43924 150 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 CLLU1Q5K131 121 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 X6R8D5 127 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-210ENST00000477812 C7orf71A4D174 169 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 J3KRW8 73 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 AKR1C3P42330 323 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 BTN1A1Q13410 526 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 TOR2AQ5JU69 321 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 PRNTQ86SH4 94 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 FMC1Q96HJ9 113 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 DERL1Q9BUN8 251 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-210ENST00000477812 ZMAT4Q9H898 229 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms